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Id summary/zemke2023Conserved/pseudobulk_atac/macaque_m1/MGCcontent_copy
Type position_score
Version 0
Summary Pseudo-bulk atac track in macaque_m1 for MGC cell type
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: m1
  • cell_type: MGC
  • data_types: atac_signal
  • dataset: zemke2023Conserved
  • modalities: ATAC
  • processing_level: RPKM_normalized
  • reference_genome: reference/Macaque/genome/rheMac10
  • resolution: pseudo_bulk_cell_type
  • sequencing_platform: Illumina
  • species: macaque
  • vendor: 10x_Genomics

Scores (1)

ID Type Default annotation Description Histogram Range Summary
zemke2023Conserved_macaque_m1_MGC_atac_rpkm float

zemke2023Conserved_macaque_m1_MGC_atac_rpkm
Pseudo-bulk RPKM atac in macaque_m1 for MGC cell type
 HISTOGRAM FOR zemke2023Conserved_macaque_m1_MGC_atac_rpkm [0, 5.47e+04]
n
2,971,331,530
mean
3.11
sd
19.7

n counts base pairs; sd is the population standard deviation.

Coverage

Chromosome Covered positions Covered % Segments
all chromosomes 2971331530 89013892
chr1 223616942 100.00% 7898028
chr2 196197964 100.00% 5654386
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chr5 187317192 100.00% 4447051
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chr16 79627064 100.00% 3588548
chr17 95433459 100.00% 2404963
chr18 74474043 100.00% 1998613
chr19 58315233 100.00% 2688881
chr20 77137495 100.00% 2959123
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chrX 153388924 100.00% 2560208
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Segment lengths

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