Resource
| Id | summary/zemke2023Conserved/pseudobulk_atac/marmoset_m1/L4_5_IT |
|---|---|
| Type | position_score |
| Version | 0 |
| Summary | Pseudo-bulk atac track in marmoset_m1 for L4_5_IT cell type |
| Description | |
| Labels |
|
Scores (1)
| ID | Type | Default annotation | Description | Histogram | Range | Summary |
|---|---|---|---|---|---|---|
| zemke2023Conserved_marmoset_m1_L4_5_IT_atac_rpkm | float |
zemke2023Conserved_marmoset_m1_L4_5_IT_atac_rpkm |
Pseudo-bulk RPKM atac in marmoset_m1 for L4_5_IT cell type
|
 |
[0, 8.97e+04] |
|
n counts base pairs; sd is the population standard deviation.
Coverage
| Chromosome | Covered positions | Covered % | Segments |
|---|---|---|---|
| all chromosomes | 2897824427 | 100.00% | 210162097 |
| chr1 | 217961735 | 100.00% | 16129689 |
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| chr1_NW_023264044v1_random | 52620 | 100.00% | 3759 |
| chr2 | 204486479 | 100.00% | 14908005 |
| chr3 | 191910223 | 100.00% | 13465354 |
| chr4 | 174041770 | 100.00% | 12674160 |
| chr5 | 164351765 | 100.00% | 12727170 |
| chr6 | 161003406 | 100.00% | 11808826 |
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| chr11 | 129688756 | 100.00% | 9751934 |
| chr11_NW_023264047v1_random | 139776 | 100.00% | 9123 |
| chr12 | 124486764 | 100.00% | 9433940 |
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| chr12_NW_023264049v1_random | 99150 | 100.00% | 7682 |
| chr13 | 118934817 | 100.00% | 8710363 |
| chr13_NW_023264050v1_random | 314474 | 100.00% | 23719 |
| chr14 | 112090317 | 100.00% | 8245599 |
| chr14_NW_023264051v1_random | 65451 | 100.00% | 2800 |
| chr15 | 99198953 | 100.00% | 7501297 |
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| chr18 | 47031477 | 100.00% | 3500089 |
| chr19 | 51570929 | 100.00% | 3865476 |
| chr20 | 45615054 | 100.00% | 3411165 |
| chr21 | 51259342 | 100.00% | 3639221 |
| chr22 | 51300780 | 100.00% | 3970737 |
| chrM | 16499 | 100.00% | 1647 |
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| chrUn_NW_023264053v1 | 32340 | 100.00% | 1442 |
| chrUn_NW_023264054v1 | 71593 | 100.00% | 3116 |
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| chrUn_NW_023264057v1 | 107634 | 100.00% | 6390 |
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| chrUn_NW_023264068v1 | 381899 | 100.00% | 17925 |
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| chrUn_NW_023264073v1 | 311392 | 100.00% | 11868 |
| chrUn_NW_023264074v1 | 310685 | 100.00% | 15459 |
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| chrUn_NW_023264166v1 | 134891 | 100.00% | 7094 |
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| chrUn_NW_023264169v1 | 159741 | 100.00% | 6191 |
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| chrUn_NW_023264181v1 | 124111 | 100.00% | 4897 |
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| chrUn_NW_023264185v1 | 118390 | 100.00% | 4130 |
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| chrUn_NW_023264188v1 | 128105 | 100.00% | 3165 |
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| chrUn_NW_023264191v1 | 113105 | 100.00% | 5058 |
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| chrUn_NW_023264195v1 | 112808 | 100.00% | 4044 |
| chrUn_NW_023264196v1 | 111917 | 100.00% | 6343 |
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| chrUn_NW_023264393v1 | 53297 | 100.00% | 1704 |
| chrUn_NW_023264394v1 | 54686 | 100.00% | 2483 |
| chrUn_NW_023264395v1 | 53970 | 100.00% | 1816 |
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| chrUn_NW_023264556v1 | 34034 | 100.00% | 293 |
| chrUn_NW_023264557v1 | 33951 | 100.00% | 1210 |
| chrUn_NW_023264558v1 | 33442 | 100.00% | 1758 |
| chrUn_NW_023264559v1 | 33608 | 100.00% | 2185 |
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| chrUn_NW_023264561v1 | 32561 | 100.00% | 1197 |
| chrUn_NW_023264562v1 | 32743 | 100.00% | 805 |
| chrUn_NW_023264563v1 | 32909 | 100.00% | 2393 |
| chrUn_NW_023264564v1 | 32852 | 100.00% | 1141 |
| chrUn_NW_023264565v1 | 31674 | 100.00% | 1236 |
| chrUn_NW_023264566v1 | 32547 | 100.00% | 1954 |
| chrUn_NW_023264567v1 | 32622 | 100.00% | 1031 |
| chrUn_NW_023264568v1 | 32031 | 100.00% | 1025 |
| chrUn_NW_023264569v1 | 32352 | 100.00% | 1097 |
| chrUn_NW_023264570v1 | 32020 | 100.00% | 363 |
| chrUn_NW_023264571v1 | 31679 | 100.00% | 1198 |
| chrUn_NW_023264572v1 | 32322 | 100.00% | 1305 |
| chrUn_NW_023264573v1 | 31145 | 100.00% | 1485 |
| chrUn_NW_023264574v1 | 30739 | 100.00% | 2026 |
| chrUn_NW_023264575v1 | 31271 | 100.00% | 1279 |
| chrUn_NW_023264576v1 | 30670 | 100.00% | 429 |
| chrUn_NW_023264577v1 | 31250 | 100.00% | 1362 |
| chrUn_NW_023264578v1 | 30300 | 100.00% | 1985 |
| chrUn_NW_023264579v1 | 30025 | 100.00% | 1175 |
| chrUn_NW_023264580v1 | 30409 | 100.00% | 1432 |
| chrUn_NW_023264581v1 | 29999 | 100.00% | 2588 |
| chrUn_NW_023264582v1 | 375 | 100.00% | 8 |
| chrUn_NW_023264583v1 | 30202 | 100.00% | 833 |
| chrUn_NW_023264584v1 | 30164 | 100.00% | 572 |
| chrUn_NW_023264585v1 | 29758 | 100.00% | 1472 |
| chrUn_NW_023264586v1 | 29652 | 100.00% | 2115 |
| chrUn_NW_023264587v1 | 29643 | 100.00% | 461 |
| chrUn_NW_023264588v1 | 29170 | 100.00% | 1603 |
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| chrUn_NW_023264590v1 | 29048 | 100.00% | 1792 |
| chrUn_NW_023264591v1 | 28807 | 100.00% | 1785 |
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| chrUn_NW_023264715v1 | 17352 | 100.00% | 1457 |
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| chrUn_NW_023264721v1 | 17029 | 100.00% | 385 |
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| chrUn_NW_023264723v1 | 16639 | 100.00% | 924 |
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| chrUn_NW_023264725v1 | 16708 | 100.00% | 1641 |
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| chrUn_NW_023264727v1 | 16218 | 100.00% | 1013 |
| chrUn_NW_023264728v1 | 16557 | 100.00% | 437 |
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| chrUn_NW_023264735v1 | 15821 | 100.00% | 301 |
| chrUn_NW_023264736v1 | 15828 | 100.00% | 790 |
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| chrUn_NW_023264738v1 | 15328 | 100.00% | 973 |
| chrUn_NW_023264739v1 | 15215 | 100.00% | 1179 |
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| chrUn_NW_023264751v1 | 14193 | 100.00% | 718 |
| chrUn_NW_023264752v1 | 14175 | 100.00% | 644 |
| chrUn_NW_023264753v1 | 14242 | 100.00% | 407 |
| chrUn_NW_023264754v1 | 13977 | 100.00% | 149 |
| chrUn_NW_023264755v1 | 14013 | 100.00% | 1298 |
| chrUn_NW_023264756v1 | 13837 | 100.00% | 973 |
| chrUn_NW_023264757v1 | 13976 | 100.00% | 376 |
| chrUn_NW_023264758v1 | 13706 | 100.00% | 760 |
| chrUn_NW_023264759v1 | 13586 | 100.00% | 465 |
| chrUn_NW_023264760v1 | 13604 | 100.00% | 750 |
| chrUn_NW_023264761v1 | 13529 | 100.00% | 184 |
| chrUn_NW_023264762v1 | 13335 | 100.00% | 1165 |
| chrUn_NW_023264763v1 | 13479 | 100.00% | 139 |
| chrUn_NW_023264764v1 | 13566 | 100.00% | 76 |
| chrUn_NW_023264765v1 | 13237 | 100.00% | 286 |
| chrUn_NW_023264766v1 | 13199 | 100.00% | 799 |
| chrUn_NW_023264767v1 | 13012 | 100.00% | 509 |
| chrUn_NW_023264768v1 | 12911 | 100.00% | 393 |
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| chrUn_NW_023264771v1 | 13107 | 100.00% | 197 |
| chrUn_NW_023264772v1 | 12792 | 100.00% | 302 |
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| chrUn_NW_023264777v1 | 12458 | 100.00% | 1114 |
| chrUn_NW_023264778v1 | 12373 | 100.00% | 477 |
| chrUn_NW_023264779v1 | 12294 | 100.00% | 42 |
| chrUn_NW_023264780v1 | 12292 | 100.00% | 241 |
| chrUn_NW_023264781v1 | 12277 | 100.00% | 85 |
| chrUn_NW_023264782v1 | 12340 | 100.00% | 374 |
| chrUn_NW_023264783v1 | 12080 | 100.00% | 588 |
| chrUn_NW_023264784v1 | 12058 | 100.00% | 835 |
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