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Id summary/zemke2023Conserved/pseudobulk_rna/macaque_m1/L2_3_ITcontent_copy
Type position_score
Version 0
Summary Pseudo-bulk rna track in macaque_m1 for L2_3_IT cell type
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: m1
  • cell_type: L2_3_IT
  • data_types: expression_signal
  • dataset: zemke2023Conserved
  • modalities: RNA
  • processing_level: RPKM_normalized
  • reference_genome: reference/Macaque/genome/rheMac10
  • resolution: pseudo_bulk_cell_type
  • sequencing_platform: Illumina
  • species: macaque
  • vendor: 10x_Genomics

Scores (1)

ID Type Default annotation Description Histogram Range Summary
zemke2023Conserved_macaque_m1_L2_3_IT_rna_rpkm float

zemke2023Conserved_macaque_m1_L2_3_IT_rna_rpkm
Pseudo-bulk RPKM rna in macaque_m1 for L2_3_IT cell type
 HISTOGRAM FOR zemke2023Conserved_macaque_m1_L2_3_IT_rna_rpkm [0, 7.14e+04]
n
2,971,331,530
mean
0.981
sd
25.6

n counts base pairs; sd is the population standard deviation.

Coverage

Chromosome Covered positions Covered % Segments
all chromosomes 2971331530 31562507
chr1 223616942 100.00% 2583098
chr2 196197964 100.00% 2213447
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chr4 169963040 100.00% 1816322
chr5 187317192 100.00% 1726853
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chr12 130043856 100.00% 1412917
chr13 108737130 100.00% 1210713
chr14 128056306 100.00% 1507031
chr15 113283604 100.00% 1257006
chr16 79627064 100.00% 1000606
chr17 95433459 100.00% 988943
chr18 74474043 100.00% 784448
chr19 58315233 100.00% 713165
chr20 77137495 100.00% 912099
chrM 16564 100.00% 328
chrX 153388924 100.00% 1297474
chrY 11753682 100.00% 90624
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ML143119.1 862827 10662
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ML143123.1 539197 4307
ML143124.1 1117261 4674
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