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Id summary/zemke2023Conserved/pseudobulk_rna/macaque_m1/L5_ITcontent_copy
Type position_score
Version 0
Summary Pseudo-bulk rna track in macaque_m1 for L5_IT cell type
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: m1
  • cell_type: L5_IT
  • data_types: expression_signal
  • dataset: zemke2023Conserved
  • modalities: RNA
  • processing_level: RPKM_normalized
  • reference_genome: reference/Macaque/genome/rheMac10
  • resolution: pseudo_bulk_cell_type
  • sequencing_platform: Illumina
  • species: macaque
  • vendor: 10x_Genomics

Scores (1)

ID Type Default annotation Description Histogram Range Summary
zemke2023Conserved_macaque_m1_L5_IT_rna_rpkm float

zemke2023Conserved_macaque_m1_L5_IT_rna_rpkm
Pseudo-bulk RPKM rna in macaque_m1 for L5_IT cell type
 HISTOGRAM FOR zemke2023Conserved_macaque_m1_L5_IT_rna_rpkm [0, 5.83e+04]
n
2,971,331,530
mean
0.984
sd
21.7

n counts base pairs; sd is the population standard deviation.

Coverage

Chromosome Covered positions Covered % Segments
all chromosomes 2971331530 23499638
chr1 223616942 100.00% 1980979
chr2 196197964 100.00% 1678852
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chr13 108737130 100.00% 904028
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chr16 79627064 100.00% 761275
chr17 95433459 100.00% 721100
chr18 74474043 100.00% 574389
chr19 58315233 100.00% 537400
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chrY 11753682 100.00% 67459
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ML143119.1 862827 9459
ML143120.1 823856 1205
ML143121.1 1005795 1858
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ML143123.1 539197 2684
ML143124.1 1117261 3007
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