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Id summary/zemke2023Conserved/pseudobulk_rna/macaque_m1/L6_ITcontent_copy
Type position_score
Version 0
Summary Pseudo-bulk rna track in macaque_m1 for L6_IT cell type
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: m1
  • cell_type: L6_IT
  • data_types: expression_signal
  • dataset: zemke2023Conserved
  • modalities: RNA
  • processing_level: RPKM_normalized
  • reference_genome: reference/Macaque/genome/rheMac10
  • resolution: pseudo_bulk_cell_type
  • sequencing_platform: Illumina
  • species: macaque
  • vendor: 10x_Genomics

Scores (1)

ID Type Default annotation Description Histogram Range Summary
zemke2023Conserved_macaque_m1_L6_IT_rna_rpkm float

zemke2023Conserved_macaque_m1_L6_IT_rna_rpkm
Pseudo-bulk RPKM rna in macaque_m1 for L6_IT cell type
 HISTOGRAM FOR zemke2023Conserved_macaque_m1_L6_IT_rna_rpkm [0, 6.5e+04]
n
2,971,331,530
mean
0.983
sd
23.8

n counts base pairs; sd is the population standard deviation.

Coverage

Chromosome Covered positions Covered % Segments
all chromosomes 2971331530 21855909
chr1 223616942 100.00% 1857949
chr2 196197964 100.00% 1537961
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chr4 169963040 100.00% 1291170
chr5 187317192 100.00% 1155582
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chr10 99517758 100.00% 773887
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chr12 130043856 100.00% 993804
chr13 108737130 100.00% 844684
chr14 128056306 100.00% 1031350
chr15 113283604 100.00% 862962
chr16 79627064 100.00% 725363
chr17 95433459 100.00% 676549
chr18 74474043 100.00% 521619
chr19 58315233 100.00% 502228
chr20 77137495 100.00% 638708
chrM 16564 100.00% 320
chrX 153388924 100.00% 828852
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ML143119.1 862827 9156
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ML143121.1 1005795 2054
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ML143123.1 539197 2461
ML143124.1 1117261 2608
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